Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms