Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms