Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms