Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBP07199 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBP07199 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBP07199 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBP07199 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBP07199 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBP07199 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBP07199 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms