Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTA1P02549 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms