Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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