Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DENRO43583 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms