Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms