Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms