Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms