Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms