Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A6NL46 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A6NL46 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A6NL46 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A6NL46 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A6NL46 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A6NL46 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A6NL46 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A6NL46 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A6NL46 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A6NL46 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A6NL46 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NL46 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NL46 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NL46 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NL46 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NL46 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms