Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP5LA4QPB2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms