Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms