Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP3Q9Y6F1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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