Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms