Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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