Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms