Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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