Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPS28Q9Y2Q9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms