Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms