Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRF3Q9ULT6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms