Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms