Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO3Q9UK99 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms