Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms