Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK1NQ9UHG2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms