Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MLH3Q9UHC1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms