Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms