Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms