Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms