Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9Q9P2J2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9Q9P2J2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9Q9P2J2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9Q9P2J2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9Q9P2J2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9Q9P2J2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9Q9P2J2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9Q9P2J2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9Q9P2J2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGSF9Q9P2J2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms