Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms