Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms