Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms