Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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