Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms