Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNA4Q9HCM2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms