Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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