Protein–RNA interactions for Protein: Q9H239

MMP28, Matrix metalloproteinase-28, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP28Q9H239 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP28Q9H239 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms