Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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