Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms