Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms