Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms