Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms