Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms