Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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