Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms