Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms