Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms