Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms